A.I. Ôparin được Nhà nước Liên xô công nhận là Anh hùng Lao động Xã hội chủ nghĩa năm 1969.

Ông giới khoa học quốc tế bầu làm Chủ tịch Hiệp hội quốc tế về nghiên cứu nguồn gốc của sự sống.

Năm 1974, Nhà nước Liên xô đã trao tặng ông giải thưởng Lênin, rồi đến năm 1979 là Huy chương vàng Lomonosôp "vì những thành tựu nổi bật trong hóa sinh".

Ông cũng được trao tặng 5 Huân chương Lênin.

Tên một tàu nghiên cứu hải dương học của Nga được đặt theo tên ông: tàu "Viện sĩ Ôparin". Con tàu này đã nhiều lần đến thăm và nghiên cứu ở Việt Nam.[6]